Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Clca3bE9PUL3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Clca3bE9PUL3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms