Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Soga1E1U8D0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Soga1E1U8D0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms