Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1110002E22RikE0CYV9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1110002E22RikE0CYV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms