Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hfm1D3Z4R1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms