Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
3425401B19RikD3Z1D3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
3425401B19RikD3Z1D3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms