Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Samd1D3YXK1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Samd1D3YXK1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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