Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rexo5D3YW29 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms