Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah3B2RWG3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah3B2RWG3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms