Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprbB2RU80 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms