Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prrt4B2RU40 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms