Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms