Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn7aB1AYL1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scn7aB1AYL1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms