Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mbd5B1AYB6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms