Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402K13RikB1AW18 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402K13RikB1AW18 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms