Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU7

Gm13178, Predicted gene 13178, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13178B1AVU7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm13178B1AVU7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms