Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NhsB1AV60 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NhsB1AV60 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NhsB1AV60 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms