Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Spocd1B1ASB6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Spocd1B1ASB6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms