Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grik3B1AS29 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grik3B1AS29 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms