Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prr29B1ARI9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prr29B1ARI9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms