Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Usp36B1AQJ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp36B1AQJ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms