Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmem238A9JSM3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms