Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr16A3KMN5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr16A3KMN5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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