Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Atp8b5A3FIN4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Atp8b5A3FIN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Atp8b5A3FIN4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Atp8b5A3FIN4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atp8b5A3FIN4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atp8b5A3FIN4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
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