Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ism1A2ATD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ism1A2ATD1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms