Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtf1A2AQ19 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rtf1A2AQ19 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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