Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms