Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ttll9A2APC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttll9A2APC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms