Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FocadA2AKG8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FocadA2AKG8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms