Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhbdl2A2AGA4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhbdl2A2AGA4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms