Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Frmpd4A2AFR3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Frmpd4A2AFR3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms