Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Prdm16A2A935 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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