Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Usp29Q9ES63 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms