Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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Atg4aQ8C9S8 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Atg4aQ8C9S8 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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