Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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NipblQ6KCD5 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NipblQ6KCD5 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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