Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Alox5ap-201ENSMUST00000071130 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Tsr1Q5SWD9 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Tsr1Q5SWD9 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms