Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Sft2d1Q5SSN7 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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