Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm28047Q3US59 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm28047Q3US59 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Gm28047Q3US59 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Gm28047Q3US59 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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Gm28047Q3US59 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Gm28047Q3US59 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Gm28047Q3US59 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Gm28047Q3US59 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Gm28047Q3US59 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Gm28047Q3US59 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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