Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc34Q3UI66 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Rgs2-204ENSMUST00000153527 588 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 1700096J18Rik-201ENSMUST00000190043 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 AC154307.1-201ENSMUST00000214799 90 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc34Q3UI66 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms