Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Trim71Q1PSW8 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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