Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SbdsP70122 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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