Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Usp46P62069 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms