Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Dnajc5b-203ENSMUST00000118968 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PdgfaP20033 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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