Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm3336J3QMQ6 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms