Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Grik3B1AS29 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms