Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac6Q9Z2V5 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac6Q9Z2V5 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms