Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms