Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Rnft1Q9DCN7 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Rnft1Q9DCN7 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms