Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms