Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rprd1bQ9CSU0 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rprd1bQ9CSU0 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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