Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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Atg4aQ8C9S8 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Atg4aQ8C9S8 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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